故事发生于万历年间。彼时大明东南沿海怪事频发，大量渔民无故失踪，一艘刻着南洋血祭字样的诡异鬼船短暂现身海面后便离奇沉没，诡异传闻四散传播，沿海百姓人心惶惶。朝廷委派锦衣卫百户萧砚南下彻查连环失踪案，他与搭档沈云伪装成普通渔民乘船出海探查线索，途中不幸遭遇海匪劫持，被掳至海外隐秘据点南大岛。